بررسی بذر بعد از جوانه زدن :

1 . روش بلاتر :متداولترین روش آزمایش سلامت بذر است در آن بذر رابر روی کاغذ صافی خیس گذاشته و 7 روز در دمای 20 تا 25 درجه سانتیگراد و در طول مدت روشنایی 12 ساعت در انکوباتور قرار می دهند سپس بذور را در زیر استریو میکروسکوپ بررسی می نمایند در این روش معمولأ از 400 بذر استفاده می شود و برای تشخیص قارچ هایی مثل Phoma lingam,Phozarium , Rhizoctonium مناسب است .

2 . روش بشقاب آگار : در این روش قارچ های بذری بر اساس خصوصیات کلونی های رشد یافته در اطراف بذر در محیط آگار کشف می شود در این روش بذر را در محیط آگار ودر انکوباتور با شرایط مساعد قرار می دهند و سپس قارچ های رشد یافته را بررسی می کنند . (این روش برای کلیه پاتوژن ها ی گیاهی قابل استفاده است ) .

آزمایش های سلامتی تشخیص باکتری های بذر :کشف باکتری در بذر 3 مرحله دارد : استخراج _ جداسازی _شناسایی

استخراج :برای استخراج چند روش بسته به اینکه باکتری بیرون بذر ویادرون بذر است وجود دارد :

1 . خیساندن بذر یا آرد بذر در درون مایع ( تهیه عصاره بذر ).

2 . قرار دادن مستقیم بذر در محیط آگار(رویاندن بذر ).

3 . رویاندن گیاه کامل از بذر (کاشتن بذر ) .

تهیه عصاره : با خیساندن بذر یا آرد بذر بمدت کوتاه ویا چند ساعت در یک محیط مایع مثل محلول بافر یا آب استریل شده باکتری ها از بذر شسته می توان عصاره را در محیط آگار قرار داد و به شناسایی باکتری ها پرداخت .

رویاندن بذر : بذر را در آگار در دمای 25 تا28درجه و بمدت 24 تا 28 ساعت تاریکی در انکوباتور قرار می دهند سپس کلونی های ایجاد شده را بررسی می کنند ، میزان درجه حرارت به نوع باکتری بستگی دارد مثلأ باکتری سودوموناس در دمای 25 درجه وباکتری  زانتو موناس در دمای 28 درجه بهترین رشد را دارند .

کاشتن : کاشت بذر 2 روش دارد یا بذر را در یک محیط رشد مناسب می رویانند و سپس اندام های ابتدائی را مانند لپه ها بررسی می کنند یا بذر را در مزرعه یا گلخانه می کارند وتا انتهای مرحله بلوغ آنرا بررسی می کنند .

جداسازی : جداسازی از 2 مرحله تشکیل شده می شود :

1 . جداسازی کل جمعیت های باکتری ها از بذر (عصاره بذر).  2 . جداسازی کلونی های مشکوک از کل جمعیت باکتری ها برای شناسایی .

شناسایی بذر :

روش های مختلفی مثل تلقیح گیاه میزبان ( اسپری ویا آمپول زدن محلول باکتری به گیاه ) آزمایش های بیوشیمیایی ، آزمایش های سرولوژی تلفیقی از این چند روش (تکنیک فاژ –پلاک ) البته روش های دیگری هم مثل آزمایش DNA ، پروفیل های اسید چرب و DIB هستند که در کشور های درحال پیشرفت کمتر استفاده می شوند .

آزمایش های بیوشیمیایی شامل :

کشت باکتری درمحیط کشت –رنگ آمیزی –محلولیت KOH – هیدرولیز آرژنین – هیدرولاز ژلاتین – تحلیل نیترات – استفاده از ترکیبات کربنی و اسید های آلی می باشد .

آزمایشهای سرولوژیکی:

سودمندترین روش برای تشخیص سریع و دقیق باکتری های بذری است و شامل آزمایش های زیر می باشد :

1 . Agglutination     2 . انتشار آگار        3 . رنگ آمیزی با DIB

4 . رنگ آمیزی با Florescence)             IF(Immono

5 . الیسا