عامل اصلی تنش برای گیاه درخاک های غرقاب کمبود اکسیژن است  ، کاهش اکسیژن قابل دسترس درشرایط غرقابی باعث کاهش توسعه ریشه وبخشهای هوایی می شود .

کاهش اکسیژن به زیر سطح مطلوب را هیپوکسی می گویند که رایج ترین شکل تنش درخاک های مرطوب است وزمانی اتفاق که ریشه ها دردوره های کوتاه غرقاب می شوند ولی قسمت بالایی تاج گیاه درشرایط کمبود اکسیژن قرارندارد فقدان کامل اکسیژن یا آنوکسی زمانی اتفاق می افتد که غرقاب بمدت طولانی تری تجربه شده باشد که این باعث می شود که میکرو اورگانیسم ها ی غیر هوازی بیشتر فعالیت بکنند غرقاب تنشی است که بسیاری از فرآیند های فیزیولوژیکی وشیمیایی راتحت تأثیر قرار می دهد که اینها عبارتند از مقدار رشد ریشه و ساقه ، ظرفیت فتوسنتزی ، تأخیردرتعادل بین هورمون ها .

تأثیرتنش غرقابی برروی تنفس باعث می شود که تنفس هوازی در اثر کمبوداکسیژن به تنفس غیرهوازی تبدیل می شود درتنفس اولین مرحله گلیکولیز می باشد که درتنفس هوازی وغیرهوازی مشترک است ومحصول نهایی اسید پیرویک است با پایان مسیر گلیکولیز واکنش های تنفس درحضور اکسیژن اسیدپیرویک را وارد تنفس هوازی درمیتوکندری می کند درحالیکه درغیاب اکسیژن این مسیر به مسیر تخمیر تبدیل می شود در مسیر تخمیر اسید پیرویک به الکل وco2 تبدیل می شود که این می تواند اتانول باشد یا اسیدلاکتیک تخمیر فرآیندی است که دارای کارایی خیلی اندک است وروی این اصل گیاه درطی این مدت نمی تواند از آن بهره ببرد چون قند های ذخیره ای بسرعت به مصرف می رسند و ذخیره انرژی سلول کم می شود .عمده ترین قسمت در گیاه که در آن فرآیند تخمیر  صورت می گیرد ریشه است .

غرقاب شدن خاک از ساخت و جابجایی سیتوکنین ها ، جیبرلین ها دربخش های هوایی جلوگیری می کند بنابراین محدود شدن دررشد برگ تا  حدودی بازتاب کمبود این هورمون های گیاهی درسافه است . بسته شدن روزنه ها درگیاهان غرقاب توسط آبسزیک اسید ایجاد می شود که بلافاصله بعد از غرقاب ترشح می شود که از ریشه انتقال پیدا می کند مقدار سنتز اتیلن درریشه هیپوکسی افزایش می یابد .

پیش ماده تولید اتیلن آمینوسیکلوپروپان کربوکسیلیک اسید ACC که جهت تولید این پیش ماده نیازی به اکسیژن نیست بنابراین ACC ازسلول های غیر هوازی به سلول های هوازی وقسمت تاج گیاه منتقل میشود ACCدر حضور اکسیژن اتیلن آزاد می کند اتیلن سبب ایجاد پروتئین های مقاومت به تنش غرقاب شده ودرحقیقت سبب تشکیل آئورانشیم ها می شود تشکیل آئورانشیم یک کانال داخلی تبادل گاز ازشاخ وبرگ هوازی به ریشه هیپوکسی  است هواازطریق روزنه های برگ یاعدسک ها ی ساقه وارد می شود و از طریق شبکه کانال های آئرانشیم به ریشه غوطه ور در آب می رسد .